RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8S1Q8NH09 359 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CYGBQ8WWM9 190 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RORBQ92753 470 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB39BQ96DA2 213 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SOX7Q9BT81 388 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ADI1Q9BV57 179 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR84Q9NQS5 396 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DYSFO75923 2080 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 H0YJX3 145 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 LMX1BO60663 402 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM20BO75063 409 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DHRS3O75911 302 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TGFAP01135 160 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHA1P01876 353 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPGP40121 348 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MPPED2Q15777 294 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FDX2Q6P4F2 183 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SPICQ8N5J4 248 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GAL3ST1Q99999 423 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MICU1Q9BPX6 476 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 AMBNQ9NP70 447 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZANQ9Y493 2812 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GTI1 187 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ISPDA4D126 451 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 INAFM1C9JVW0 142 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CLIC3O95833 236 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV2-5P01817 119 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL1P22362 96 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTA2P62736 377 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTG2P63267 376 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDX4Q13162 271 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GALEQ14376 348 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DOK3Q7L591 496 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 COMMD2Q86X83 199 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PIGCQ92535 297 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ITPKCQ96DU7 683 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF649Q9BS31 505 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 JAM3Q9BX67 310 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM165Q9HC07 324 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF7Q9UBF6 113 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GNG8Q9UK08 70 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 V9GYS6 101 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IRGMA1A4Y4 181 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM210A6NLX4 147 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM157AC9JC47 383 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PPIAL4DF5H284 164 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GRPP07492 148 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CFHR2P36980 270 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR12D2P58182 307 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMYND11Q15326 602 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TP53I3Q53FA7 332 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SYS1Q8N2H4 156 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TFAP2CQ92754 450 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.16□□□□□ -0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms