RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf72A6NCS6 295 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 H3BUT2 72 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 RHOQP17081 205 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 IER3P46695 156 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 WNT3P56703 355 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FABP5Q01469 135 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF787Q6DD87 383 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DOLPP1Q86YN1 238 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TSSK2Q96PF2 358 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CA10Q9NS85 328 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ETV7Q9Y603 341 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 PLPP1O14494 284 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LMX1BO60663 402 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CT45A10P0DMU9 189 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PPIAL4FP0DN26 164 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 SDC1P18827 310 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SFTPDP35247 375 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 XCR1P46094 333 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LYG2Q86SG7 212 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 KAZALD1Q96I82 304 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GPR174Q9BXC1 333 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FZD8Q9H461 694 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 NESP48681 1621 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ROBO3Q96MS0 1386 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DNMBPQ6XZF7 1577 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQM1 296 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C3orf80F5H4A9 247 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR2J3O76001 311 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SYNGR4O95473 234 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SOD1P00441 154 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DS4P43632 304 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GLIPR1P48060 266 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 EMP2P54851 167 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SHC2P98077 582 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TEX26Q8N6G2 289 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR8B12Q8NGG6 310 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR4A16Q8NH70 328 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPC1 479 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TLCD2A6NGC4 264 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR5B21A6NL26 309 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 M0QYG6 137 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HRH1P35367 487 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR3A4PP47883 348 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LEG1Q6P5S2 330 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LYG1Q8N1E2 194 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 D2HGDHQ8N465 521 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 IL17REQ8NFR9 667 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ABHD4Q8TB40 342 aa5.04□□□□□ -1.6
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