RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 KRT84Q9NSB2 600 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 LAMP5Q9UJQ1 280 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 NUP50Q9UKX7 468 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 OOEPA6NGQ2 149 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 HAX1O00165 279 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ADAM20O43506 726 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ALOX5APP20292 161 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 DDOSTP39656 456 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GMFBP60983 142 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 USP43Q70EL4 1123 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PARP8Q8N3A8 854 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R14AQ96A00 147 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ITPKCQ96DU7 683 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TEAD3Q99594 435 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SP140LQ9H930 580 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 C14orf119Q9NWQ9 140 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 AP4S1Q9Y587 144 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 G3V2T6 193 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TRIM77I1YAP6 450 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PHYHO14832 338 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FSTL3O95633 263 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TFF1P04155 84 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FPR2P25090 351 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FASP25445 335 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GNALP38405 381 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FGF12P61328 243 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PRDX4Q13162 271 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 WDR82Q6UXN9 313 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SPERTQ8NA61 448 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PIGCQ92535 297 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TEX12Q9BXU0 123 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FAM206AQ9NX38 181 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZAR1LA6NP61 321 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CDIPTO14735 213 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 LHBP01229 141 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SFTPBP07988 381 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CFL1P23528 166 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RASSF2P50749 326 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ESRRGP62508 458 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 C12orf73Q69YU5 71 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 UPRTQ96BW1 309 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 IL4I1Q96RQ9 567 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 JMJD8Q96S16 334 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CIB1Q99828 191 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 NIPAL2Q9H841 368 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 IKZF2Q9UKS7 526 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ANXA2P2A6NMY6 339 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TMPRSS2O15393 492 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ATP5HO75947 161 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 APOL3O95236 402 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CXCR4P61073 352 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MZT1Q08AG7 82 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TEX36Q5VZQ5 186 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 COMMD2Q86X83 199 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FAM216BQ8N7L0 139 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms