RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10A2	Q9H208	303 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	RGCC	Q9H4X1	137 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738		A6NLC8	198 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAM20	O43506	726 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	E2F6	O75461	281 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	H2BFM	P0C1H6	154 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MTNR1A	P48039	350 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	FGF12	P61328	243 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CD276	Q5ZPR3	534 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CPO	Q8IVL8	374 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8S1	Q8NH09	359 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TECTB	Q96PL2	329 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	YY1AP1	Q9H869	796 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TIPRL	O75663	272 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GYPA	P02724	150 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LIPF	P07098	398 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP9	P14780	707 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ALOX5AP	P20292	161 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CFHR2	P36980	270 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OCLN	Q16625	522 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR82	Q6UXN9	313 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	THEM6	Q8WUY1	208 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ITPKC	Q96DU7	683 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NRBF2	Q96F24	287 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PGAM5	Q96HS1	289 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BRD7	Q9NPI1	651 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF879	B4DU55	563 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ACKR3	P25106	362 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BPIFB3	P59826	476 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CSNK2B	P67870	215 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SNCB	Q16143	134 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT74	Q7RTS7	529 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LYZL4	Q96KX0	146 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NIPAL2	Q9H841	368 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	FAHD1	Q6P587	224 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	FTMT	Q8N4E7	242 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC29	Q8WV35	223 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TBX15	Q96SF7	602 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LRP12	Q9Y561	859 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SRRM5	B3KS81	715 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RY10	O00398	339 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	DVL1	O14640	695 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CDIPT	O14735	213 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GSC2	O15499	205 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CST4	P01036	141 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SFTPB	P07988	381 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GNAL	P38405	381 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	DAP	P51397	102 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CRISP1	P54107	249 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	IL5RA	Q01344	420 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MICB	Q29980	383 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR157	Q5UAW9	335 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SIRPD	Q9H106	197 aa		14.66	□□□□□ -0.06

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