RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 KCNK6Q9Y257 313 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CBY3A6NI87 242 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF727A8MUV8 499 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KLK10O43240 276 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NME2P1O60361 137 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ALOX12BO75342 701 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TNFSF13O75888 250 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR2J2O76002 312 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SCGNO76038 276 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLCO2B1O94956 709 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TOMM40O96008 361 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LCATP04180 440 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NPPBP16860 134 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TEAD1P28347 426 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CD1BP29016 333 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR3A2P47893 321 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CEBPGP53567 150 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HIST1H3AP68431 136 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RUNX2Q13950 521 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CRMP1Q14194 572 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RAB11BQ15907 218 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 STPG1Q5TH74 334 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MDGA2Q7Z553 956 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LINC01551Q86U37 167 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR2L13Q8N349 312 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF563Q8TA94 476 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CFHR4Q92496 578 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SUSD6Q92537 303 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IGSF8Q969P0 613 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 C2orf50Q96LR7 162 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MSRAQ9UJ68 235 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NAGKQ9UJ70 344 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PADI1Q9ULC6 663 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 A0A0G2JN53 185 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 F8WDY8 70 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 M0QYG6 137 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 XKRYO14609 159 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HSD17B6O14756 317 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CCL25O15444 150 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 STK17BO94768 372 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KAT7O95251 611 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RGRP47804 291 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 UBE2G2P60604 165 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RNF151Q2KHN1 245 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RNF44Q7L0R7 432 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CHST9Q7L1S5 443 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF429Q86V71 674 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 COX18Q8N8Q8 333 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR4X1Q8NH49 305 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HAS2Q92819 552 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 DGAT2Q96PD7 388 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SLC6A7Q99884 636 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 GINS3Q9BRX5 216 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 AHSPQ9NZD4 102 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TTC3P53804 2025 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms