RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 KPTNQ9Y664 436 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 C2orf72A6NCS6 295 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 TAAR5O14804 337 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF217O75362 1048 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SCGNO76038 276 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 COX15Q7KZN9 410 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC22A24Q8N4F4 322 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 WWTR1Q9GZV5 400 aa16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 FTCDNL1E5RQL4 147 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A18H0YCH9 400 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 PI3P19957 117 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 Q7L0L9 218 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ASB10Q8WXI3 467 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC39A7Q92504 469 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 HLA-CQ95604 372 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM206AQ9NX38 181 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 CEACAM18A8MTB9 384 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SYT7O43581 403 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8U9P0C7N5 309 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP16P51512 607 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 NSDHLQ15738 373 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 PCK2Q16822 640 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 VAX1Q5SQQ9 334 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8U1Q8NH10 309 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 MMACHCQ9Y4U1 282 aa16.22■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM265A0A087WTH1 108 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 A6NLC8 198 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV2-70P01814 119 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 PET100P0DJ07 73 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 S100A10P60903 97 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 IL15RAQ13261 267 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 TGIF1Q15583 401 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGN3Q15651 99 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6ZRG5 221 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 DMDP11532 3685 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0A6YYD4 124 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV2-5P01817 119 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 HKR1P10072 659 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 EMP2P54851 167 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF7P61962 342 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM268Q5VZI3 342 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF600Q6ZNG1 722 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 ARRDC1Q8N5I2 433 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM104Q8NE00 496 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 SLAMF6Q96DU3 332 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNK17Q96T54 332 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 EMC6Q9BV81 110 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 GSKIPQ9P0R6 139 aa16.21■□□□□ 0.19
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP54Q96N23 3096 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PR77 199 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL12A8MUP2 240 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNL1O43396 289 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CLN5O75503 358 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ADH6P28332 368 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FASLGP48023 281 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 BLKP51451 505 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN6P56747 220 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXL2P58012 376 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 AWAT1Q58HT5 328 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 LMX1AQ8TE12 382 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 TAAR9Q96RI9 348 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 PBOV1Q9GZY1 135 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FBLN5Q9UBX5 448 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PPH5 198 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 C7orf77A4D0Y5 90 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CST4P01036 141 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8U8P0C7N1 319 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FPR2P25090 351 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ACKR3P25106 362 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CD27P26842 260 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CD38P28907 300 aa16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 PMELP40967 661 aa16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms