RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 HEXBP07686 556 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRM2P08172 466 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 GSK3AP49840 483 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM50BP56557 158 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM128Q5BJH2 165 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IFI44Q8TCB0 444 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT2BQ93097 391 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 H0YIZ8 118 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG12O94817 140 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R31P59538 309 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM230Q96A57 120 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TPT1P13693 172 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ESX1Q8N693 406 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMED6Q8WW62 240 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 FBLN5Q9UBX5 448 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM218A2RU14 115 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PGA4P0DJD7 388 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PGA3P0DJD8 388 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 POC1BQ8TC44 478 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NMES1Q9C002 83 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A15Q9H2J7 730 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR132Q9UNW8 380 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PNV4 684 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF814B7Z6K7 855 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHG1P01857 330 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 GABREP78334 506 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ARFRP1Q13795 201 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SGCAQ16586 387 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCC3Q6UW78 93 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 BAP18Q8IXM2 172 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5D18Q8NGL1 313 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCD4O14678 606 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTL6AO96019 429 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF17P17021 662 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CX3CR1P49238 355 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 GUCA2BQ16661 112 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM57BQ71RH2 274 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NAA40Q86UY6 237 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5B2Q96R09 309 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB19A4D1S5 217 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MSGN1A6NI15 193 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 F8VVB4 439 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 F8VWA3 439 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF16O43320 207 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SCRG1O75711 98 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 HTR3BO95264 441 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCYAP1P18509 176 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PLPPR5Q32ZL2 321 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CARFQ8N187 725 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 STOML3Q8TAV4 291 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NPRL2Q8WTW4 380 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MAFIPQ8WZ33 124 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RAMP1O60894 148 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SFTPDP35247 375 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5H2Q8NGV7 314 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL7AQ9H8H3 244 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MOB1AQ9H8S9 216 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CYTL1Q9NRR1 136 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 R4GN57 208 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFHX4Q86UP3 3567 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R296 226 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MASP2O00187 686 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 AMY2BP19961 511 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms