RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXH1O75593 365 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP2K3P46734 347 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF826PQ6ZT77 177 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB108BQ8NET1 73 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OR51E1Q8TCB6 317 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGCQ92535 297 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM246Q9BRR3 403 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM118AQ9NWS6 357 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 AASSQ9UDR5 926 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 R4GMQ9 66 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA2Q9BZC7 2435 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL15A6NJ78 407 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 A6NLC8 198 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD65E5RJM6 399 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 F5H0A9 414 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT8P05787 483 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CPT2P23786 658 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SRP14P37108 136 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MTNR1AP48039 350 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 IL5RAQ01344 420 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDX4Q13162 271 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF404Q494X3 552 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 COMMD2Q86X83 199 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf53Q8IXP5 236 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 GALNT4Q8N4A0 578 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 YIPF7Q8N8F6 280 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 C19orf18Q8NEA5 215 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1M1Q8NGA1 313 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ITFG2Q969R8 447 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RNFT2Q96EX2 444 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MICU1Q9BPX6 476 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR84Q9NQS5 396 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MIOXQ9UGB7 285 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52A1Q9UKL2 312 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX5Q9Y5X3 404 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ANXA2P2A6NMY6 339 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RPP14O95059 124 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV3-1P01715 115 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TTRP02766 147 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V1B1P15313 513 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN26Q16670 478 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF684Q5T5D7 378 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT74Q7RTS7 529 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR86Q86TI4 376 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ELMOD2Q8IZ81 293 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOXF1Q8NHV9 184 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5P3Q8WZ94 311 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ITPKCQ96DU7 683 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP17.67■□□□□ 0.429e-15■■□□□ 12.4
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0G2JMP0 313 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0X1KG70 313 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SNTNA6NMZ2 147 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MPZL2O60487 215 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SULT1C4O75897 302 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LHBP01229 141 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 GABRB1P18505 474 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ESCO2Q56NI9 601 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL2L15Q5TBC7 163 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF12L2Q5VW00 463 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LIPNQ5VXI9 398 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ENTHD1Q8IYW4 607 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4M2Q8NGB6 313 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF170Q96K19 258 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MOB1AQ9H8S9 216 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCB9Q9NP78 766 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC2LH3BP13 241 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 J3QRE1 110 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LGALS8O00214 317 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A6O15403 523 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 AVPP01185 164 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS2P15880 293 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 GATA3P23771 443 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF85Q03923 595 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF154Q13106 437 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC36Q1X8D7 754 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LYPD2Q6UXB3 125 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 THAP5Q7Z6K1 395 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 Q96MT0 163 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RTL8AQ9BWD3 113 aa17.65■□□□□ 0.42
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