RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 COL9A1P20849 921 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM128Q5BJH2 165 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GINS3Q9BRX5 216 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GAB2Q9UQC2 676 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 LCN15Q6UWW0 184 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf45Q96LM5 186 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 CHST6Q9GZX3 395 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SLC17A5Q9NRA2 495 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPTL7O43827 346 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 DTYMKP23919 212 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2G2P60604 165 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF425Q6IV72 752 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL14Q8N1E6 418 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PPP5D1E7EU14 171 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MT-CO3P00414 261 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 LIMS3P0CW19 117 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 LIMS4P0CW20 117 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 FUT7Q11130 342 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TRILQ7L0X0 811 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MBP02144 154 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00303Q3SY05 128 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 WDR38Q5JTN6 314 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 CEP290O15078 2479 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZFPL1O95159 310 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 EPPINO95925 133 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 POU2F2P09086 479 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 C21orf58P58505 322 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GSG1Q2KHT4 349 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ACER2Q5QJU3 275 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf79Q96F83 325 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GNG3P63215 75 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS13Q6UX07 377 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRG3Q86Y34 549 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 OR10Z1Q8NGY1 313 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GALMQ96C23 342 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM11P17152 192 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 CSN1S1P47710 185 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP64Q9NPA5 681 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 AQP7O14520 342 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 CT45A10P0DMU9 189 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 RPL11P62913 178 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf10Q9HB07 376 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC4Q9Y296 219 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PDZK1IP1Q13113 114 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF141Q15928 474 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 DMRTC1Q5HYR2 192 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 UQCC2Q9BRT2 126 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MBTPS2O43462 519 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 RPS16P62249 146 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 FMODQ06828 376 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 Q8IYB0 196 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 EXTL1Q92935 676 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 OR6C68A6NDL8 312 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 IL5P05113 134 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 COX5AP20674 150 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA6P56556 154 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZIC1Q15915 447 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PLA1AQ53H76 456 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF680Q8NEM1 530 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 CD37P11049 281 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 P2RX3P56373 397 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 XAF1Q6GPH4 301 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SKA3Q8IX90 412 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 IER2Q9BTL4 223 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf24Q9BUV8 137 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ICMTO60725 284 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G3Q9NZ20 509 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 IGHA2P01877 340 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 OR4S1Q8NGB4 309 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 OR4D9Q8NGE8 314 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TAAR6Q96RI8 345 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF727A8MUV8 499 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 HAGHQ16775 308 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TIGITQ495A1 244 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms