RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF4O60810 478 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA7AO75326 666 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CHRNA7P36544 502 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 AADACL3Q5VUY0 350 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZSR6 202 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LILRA2Q8N149 483 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 FAM181AQ8N9Y4 354 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 FAM122AQ96E09 287 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TEAD3Q99594 435 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NGFRP08138 427 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR5AL1P0C617 328 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ARSAP15289 507 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 DRD5P21918 477 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ADH7P40394 386 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LCN2P80188 198 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR7A5Q15622 319 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 BATFQ16520 125 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NPWQ8N729 165 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GPR119Q8TDV5 335 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NEIL2Q969S2 332 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 POM121L2Q96KW2 1035 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GGACTQ9BVM4 153 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0B4J203 849 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR52A4PA6NMU1 304 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 FCGR2CP31995 323 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CT83Q5H943 113 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LIPNQ5VXI9 398 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF738Q8NE65 137 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1456Q9P272 454 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A13Q9Y226 551 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 KCNK7Q9Y2U2 307 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0D9SEW6 157 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CYR61O00622 381 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MBTPS2O43462 519 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MELTFP08582 738 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR5G3P0C626 314 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 G6PCP35575 357 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SOX2P48431 317 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NHLH2Q02577 135 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR5R1Q8NH85 324 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 Q96M85 177 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF724A8MTY0 619 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 A8MU76 341 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DQA1P01909 254 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 P2RY2P41231 377 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HAAOP46952 286 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 Q6AWC8 147 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SAXO1Q8IYX7 474 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PRSS37A4D1T9 235 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SSR4P51571 173 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 RIGQ13278 110 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR52N5Q8NH56 324 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SH2D2AQ9NP31 389 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms