RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 PPT1P50897 306 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 CTXN1P60606 82 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 TAF13Q15543 124 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 LY6G6FQ5SQ64 297 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 GLT8D1Q68CQ7 371 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 TMPPEQ6ZT21 453 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 EXTL1Q92935 676 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 MFRPQ9BY79 579 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 F5H0A9 414 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 MKRN2OSH3BPM6 223 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PIN1P1O15428 100 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR2F2O95006 317 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 FARS2O95363 451 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 HEXAP06865 529 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR2T7P0C7T2 308 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PRF1P14222 555 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ACTA2P62736 377 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ACTG2P63267 376 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR2F1Q13607 317 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 Q3ZCU0 254 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR2T27Q8NH04 317 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 HAVCR1Q96D42 359 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 CHST11Q9NPF2 352 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0J9YW62 118 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 COLCA2A8K830 154 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 CD14P08571 375 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 MNDAP41218 407 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 FABP9Q0Z7S8 132 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 GGNQ86UU5 652 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SYS1Q8N2H4 156 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR6N1Q8NGY5 312 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 RAB40AQ8WXH6 277 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SGK3Q96BR1 496 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 TNFSF18Q9UNG2 199 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 A0A087WV48 116 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SULT2B1O00204 365 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 TNFSF11O14788 317 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PMS2P2O95744 297 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SELLP14151 372 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 KDM8Q8N371 416 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 STEAP2Q8NFT2 490 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 RASD2Q96D21 266 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 LIPGQ9Y5X9 500 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 MEIS3P1A6NDR6 274 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 GJE1A6NN92 205 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR2AT4A6NND4 320 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 MS4A18H0YCH9 400 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ARPC3O15145 178 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR6A2O95222 327 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 FBP1P09467 338 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 KLK2P20151 261 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 CXADRP78310 365 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 MS4A18Q3C1V0 323 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ARL11Q969Q4 196 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 Q96M85 177 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN32Q96QS1 320 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 TCEAL7Q9BRU2 100 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 V9GY05 133 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF814B7Z6K7 855 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ST8SIA5O15466 376 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PLGP00747 810 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ITGB2P05107 769 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 P2RY4P51582 365 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF345Q14585 488 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 AKIRIN2Q53H80 203 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 C9orf152Q5JTZ5 239 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 LRRTM1Q86UE6 522 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ASB13Q8WXK3 278 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD17AQ96GS6 310 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SEC11CQ9BY50 192 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 POFUT1Q9H488 388 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 COMMD9Q9P000 198 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-DOBP13765 273 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 GTF2F2P13984 249 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF44P15621 663 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SLC10A1Q14973 349 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 RNF212Q495C1 297 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZS92 163 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 OR8S1Q8NH09 359 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB127Q9H1M4 99 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 ACKR4Q9NPB9 350 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa17.9■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 RNF222A6NCQ9 220 aa17.9■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 APEHP13798 732 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
UBE2B-201ENST00000265339 SDHAP31040 664 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms