RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 HLA-HP01893 362 aa12.13□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 WDR31Q8NA23 367 aa12.13□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 OR10P1Q8NGE3 313 aa12.13□□□□□ -0.47
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PDGFRB-201ENST00000261799 LPAR3Q9UBY5 353 aa12.13□□□□□ -0.47
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PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1W2PRF3 423 aa12.13□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1W2PRM7 423 aa12.13□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 TXNL1O43396 289 aa12.13□□□□□ -0.47
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PDGFRB-201ENST00000261799 ZBTB25P24278 435 aa12.13□□□□□ -0.47
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PDGFRB-201ENST00000261799 FAM221AA4D161 298 aa12.12□□□□□ -0.47
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PDGFRB-201ENST00000261799 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.11□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 FOXJ3Q9UPW0 622 aa12.11□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A0B4J2A0 478 aa12.11□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
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PDGFRB-201ENST00000261799 PEX11BO96011 259 aa12.11□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 CCL3P10147 92 aa12.11□□□□□ -0.47
PDGFRB-201ENST00000261799 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
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