RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 HCCSP53701 268 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 IL5RAQ01344 420 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 LYPD2Q6UXB3 125 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 ZNF826PQ6ZT77 177 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 AMIGO2Q86SJ2 522 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 COMMD2Q86X83 199 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 FAM81AQ8TBF8 368 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 RAB40AQ8WXH6 277 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 ZNF319Q9P2F9 582 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 ERVK-18Q9QC07 812 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa18.15■□□□□ 0.5
NME4-201ENST00000219479 NDUFA2O43678 99 aa18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 NPY4RP50391 375 aa18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 SGMS2Q8NHU3 365 aa18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ASB17Q8WXJ9 295 aa18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 LRTOMTQ8WZ04 291 aa18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 RTL8AQ9BWD3 113 aa18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ABCB9Q9NP78 766 aa18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 IKZF2Q9UKS7 526 aa18.14■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 CCDC182A6NF36 153 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 SLC22A31A6NKX4 558 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PSMD9O00233 223 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ADAM20O43506 726 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PAX8Q06710 450 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 SLX4IPQ5VYV7 408 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 CD276Q5ZPR3 534 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 KDM4DQ6B0I6 523 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 DEGS2Q6QHC5 323 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 KCTD8Q6ZWB6 473 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 TCEANCQ8N8B7 351 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 OR1M1Q8NGA1 313 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 OR8B12Q8NGG6 310 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 LRRC29Q8WV35 223 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 MPC1Q9Y5U8 109 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa18.13■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 M0R129 80 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ENSAO43768 121 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 GYPAP02724 150 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PSMB10P40306 273 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PRDX4Q13162 271 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 GCSAMQ8N6F7 178 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 TMEM163Q8TC26 289 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 TTTY10Q9BZA0 68 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa18.12■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ACOD1A6NK06 481 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ZAR1LA6NP61 321 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF850A8MQ14 1090 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 KCNAB3O43448 404 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF254O75437 659 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 RIDAP52758 137 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 CSNK2BP67870 215 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PAX2Q02962 417 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 MICBQ29980 383 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 NXNL2Q5VZ03 156 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 GID4Q8IVV7 300 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF679Q8IYX0 411 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PIGCQ92535 297 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 IL4I1Q96RQ9 567 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 CIB1Q99828 191 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF69Q9UC07 566 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 OAZ3Q9UMX2 235 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa18.11■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PPIAL4GP0DN37 164 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ACKR3P25106 362 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 EPHA2P29317 976 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 MAP2K3P46734 347 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ACTR3P61158 418 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 C12orf73Q69YU5 71 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF841Q6ZN19 808 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 CCDC121Q6ZUS5 278 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 WDR86Q86TI4 376 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 FAM90A1Q86YD7 464 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 SLC35F2Q8IXU6 374 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 ITPKCQ96DU7 683 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 LYZL4Q96KX0 146 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 OR8B4Q96RC9 309 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PKP2Q99959 881 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 RIBC2Q9H4K1 309 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 FAM206AQ9NX38 181 aa18.1■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa18.09■□□□□ 0.49
NME4-201ENST00000219479 A0A0U1RQV5 110 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms