RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204679.8

GNPTG-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTG, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-201ENST00000204679 GSK3AP49840 483 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 FAAP20Q6NZ36 180 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 FAM214BQ7L5A3 538 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 TMEM104Q8NE00 496 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 CMBLQ96DG6 245 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 LUZP4Q9P127 313 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 RAB27BO00194 218 aa20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 FCER2P06734 321 aa20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 FAM3AP98173 230 aa20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 TFAP2EQ6VUC0 442 aa20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 C9orf106Q8NAJ2 232 aa20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.09■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 XRCC2O43543 280 aa20.08■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 COX5BP10606 129 aa20.08■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 RAB12Q6IQ22 244 aa20.08■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 COLCA1Q6ZS62 124 aa20.08■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.08■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 SEH1LQ96EE3 360 aa20.08■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 MCUBQ9NWR8 336 aa20.08■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 COPZ2Q9P299 210 aa20.08■□□□□ 0.81
GNPTG-201ENST00000204679 WIPF3A6NGB9 483 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 MPIG6BO95866 241 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 PTGFRP43088 359 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 VEGFCP49767 419 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 PLP2Q04941 152 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF585AQ6P3V2 769 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 CHST4Q8NCG5 386 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 GPX8Q8TED1 209 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 NICN1Q9BSH3 213 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 BANF2Q9H503 90 aa20.08■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 A0A1W2PP11 408 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 TMEM235A6NFC5 223 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 NAP1L6A6NFF2 107 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 HMX3A6NHT5 357 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 GUSBP1Q15486 140 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 GSG1Q2KHT4 349 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 SLC22A6Q4U2R8 563 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 WNT2BQ93097 391 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 LHX6Q9UPM6 363 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 WASF3Q9UPY6 502 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.07■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 CDC14BO60729 498 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 LPLP06858 475 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 CSF1P09603 554 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 HLA-DMAP28067 261 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 BTG1P62324 171 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 MS4A3Q96HJ5 214 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 ING4Q9UNL4 249 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 CACNA1GO43497 2377 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 GTF3C1Q12789 2109 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 AHRRA9YTQ3 701 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 UBBP0CG47 229 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 OR8B8Q15620 311 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 Q6ZTK2 550 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 SPSB4Q96A44 273 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.06■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 GTF2F2P13984 249 aa20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 IGHV1-2P23083 117 aa20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 MTCP1P56278 107 aa20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 OR6F1Q8NGZ6 308 aa20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 SCPEP1Q9HB40 452 aa20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.05■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 A0A0A6YYD4 124 aa20.04■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 OR14I1A6ND48 311 aa20.04■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 SULT1C2O00338 296 aa20.04■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 RAD51DO75771 328 aa20.04■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 DHFRP00374 187 aa20.04■□□□□ 0.8
GNPTG-201ENST00000204679 NRASP01111 189 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms