RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 CBX5P45973 191 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 GFRA1P56159 465 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 CLDN15P56746 228 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 GMFBP60983 142 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 CXADRP78310 365 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 DHODHQ02127 395 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 FOXO1Q12778 655 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ARL6IP1Q15041 203 aa7.24□□□□□ -1.25
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VAMP3-201ENST00000054666 OR1C1Q15619 314 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 NAA40Q86UY6 237 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM104Q8NE00 496 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.24□□□□□ -1.25
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VAMP3-201ENST00000054666 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SLC6A7Q99884 636 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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VAMP3-201ENST00000054666 OPN4Q9UHM6 478 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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VAMP3-201ENST00000054666 OR6C6A6NF89 314 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 E9PLN8 166 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SYNGR3O43761 229 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 NEURL1O76050 574 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 TNFSF15O95150 251 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SYNGR4O95473 234 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 LCATP04180 440 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 FCGR2AP12318 317 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF32P17041 273 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SERPINA2P20848 420 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 CRYGSP22914 178 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 CD34P28906 385 aa7.24□□□□□ -1.25
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VAMP3-201ENST00000054666 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 PLGLB1Q02325 96 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ARFRP1Q13795 201 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 CSRP2Q16527 193 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 OR52W1Q6IF63 320 aa7.24□□□□□ -1.25
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VAMP3-201ENST00000054666 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 OR4K15Q8NH41 348 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ABHD3Q8WU67 409 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 HAS2Q92819 552 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM45BQ96B21 275 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SPSB1Q96BD6 273 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 REEP6Q96HR9 211 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 PCSK5Q92824 1860 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 A0A0A6YYD4 124 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 C5orf63A6NC05 138 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 WIPF3A6NGB9 483 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SOCS1O15524 211 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 HPNP05981 417 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF806P0C7X5 589 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 MGMTP16455 207 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 CPT2P23786 658 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ALDH3B1P43353 468 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 DHRS2Q13268 280 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 GRK1Q15835 563 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 RTL6Q6ICC9 239 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 Q6ZSR3 168 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 SLC39A7Q92504 469 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 PIGTQ969N2 578 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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