RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ApelaP0DMC4 54 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrkcaP20444 672 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cst3P21460 140 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CdaP56389 146 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lsm6P62313 80 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crybb2P62696 205 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tubg1P83887 451 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc30a2Q2HJ10 371 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ceacam19Q3TQ88 271 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtl6Q505G4 243 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CfiQ61129 603 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 2210407C18RikQ6YI28 220 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr298Q7TS06 332 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd10Q80X66 475 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acsm5Q8BGA8 578 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tctn1Q8BZ64 593 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Saysd1Q8K190 188 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1450Q8VF19 325 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1417Q8VGJ6 315 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr658Q8VGV5 323 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhga3Q91XY5 928 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AassQ99K67 926 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Setd6Q9CWY3 473 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700034E13RikQ9D2T6 108 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rsph14Q9D3W1 341 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr20Q9D5R2 567 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss8Q9ESD1 342 aa9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ClpxQ9JHS4 634 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1375A0A0N4SUP0 313 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm36368A0A1D5RLK8 91 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem185aA2AF53 350 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scml2B1AVB3 969 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r57K7N731 310 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P20040 264 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mapk14P47811 360 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rfx3P48381 749 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AhcyP50247 432 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1cbP62141 327 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh10P70408 788 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinf1P97298 417 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psme2P97372 239 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smrp1Q2MH31 260 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc2a6Q3UDF0 497 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acsm3Q3UNX5 580 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav6d-4Q5R1I0 115 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Xlr3aQ60595 226 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il17aQ62386 158 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc22a13Q6A4L0 551 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vstm2lQ6PDS0 220 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf503Q7TMA2 652 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr58Q7TRF6 309 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr169Q7TS53 313 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mogat2Q80W94 334 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jazf1Q80ZQ5 243 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr361Q8VF16 322 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr494Q8VG07 314 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr578Q8VH17 313 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcg5Q99PE8 652 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl41Q9CQN7 135 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl18Q9CZ09 362 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc83Q9D4V3 305 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PacrgQ9DAK2 241 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp5hQ9DCX2 161 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tenm2Q9WTS5 2764 aa9.48□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dock11A2AF47 2073 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-M5A7VMS3 348 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4175D3YTW8 314 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm15737D3YZR0 106 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r91E9PZR7 307 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r25H3BLP0 302 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r27K7N688 303 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr898L7N1Z5 316 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atf6bO35451 699 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dync1i1O88485 628 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PomcP01193 235 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtnd1P03888 318 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpy19l2P0CW70 773 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bmi1P25916 324 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DcnP28654 354 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agtr1bP29755 359 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsd17b8P50171 259 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crabp1P62965 137 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr125Q14AJ9 320 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdss2Q33DR3 401 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp729aQ4QQP3 973 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrmoQ562D6 431 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr151Q60893 309 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tfap2cQ61312 449 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcap29Q61334 240 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hand1Q64279 216 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1222Q7TR02 311 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl42Q8BFQ9 493 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.6 ms