RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DHX58	Q96C10	678 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IFNK	Q9P0W0	207 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYO1F	O00160	1098 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FNTA	P49354	379 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NECAB1	Q8N987	351 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MEIS3	Q99687	375 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	INPP5B	P32019	993 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NF2	P35240	595 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CRYM	Q14894	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ME3	Q16798	604 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDX11	Q96FC9	970 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RNF40	O75150	1001 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GNG11	P61952	73 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP2B2	Q01814	1243 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MBIP	Q9NS73	344 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EBAG9	O00559	213 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHUK	O15111	745 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NRDC	O43847	1150 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP7A	Q04656	1500 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VSNL1	P62760	191 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AGL	P35573	1532 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CTAGE5	O15320	804 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CUTA	O60888	179 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYBL2	P10244	700 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IQCA1	Q86XH1	822 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBPF3	Q9H094	633 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EHD4	Q9H223	541 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CAND2	O75155	1236 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERLIN1	O75477	346 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMEM139	Q8IV31	216 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KAT14	Q9H8E8	782 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.03	□□□□□ -0.8

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