RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637500.1

TCF4-287, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-287	ENST00000637500	TIAF1	O95411	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	TSPAN15	O95858	294 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	RAP1GAP	P47736	663 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	WASHC4	Q2M389	1173 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ZAR1	Q86SH2	424 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	TRIM50	Q86XT4	487 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ADAM19	Q9H013	955 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	RBSN	Q9H1K0	784 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	KLK14	Q9P0G3	267 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	FAM170B	A6NMN3	283 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	USP17L5	A8MUK1	530 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	KRT1	P04264	644 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	EPHA1	P21709	976 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ATP11A	P98196	1134 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	PLCL1	Q15111	1095 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	WNT8B	Q93098	351 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	C20orf173	Q96LM9	149 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	CSRNP1	Q96S65	589 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ALG2	Q9H553	416 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	USP20	Q9Y2K6	914 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	FUT4	P22083	530 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	CDC25B	P30305	580 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	FDX2	Q6P4F2	183 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	SIX5	Q8N196	739 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	ZMYND15	Q9H091	742 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TCF4-287	ENST00000637500	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	RXRB	P28702	533 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	ATP1A2	P50993	1020 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	KRTAP10-2	P60368	255 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	DGKZ	Q13574	1117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	NFKBIB	Q15653	356 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CEP135	Q66GS9	1140 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	PAOX	Q6QHF9	649 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	OR13H1	Q8NG92	308 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	KIF4A	O95239	1232 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	INHBB	P09529	407 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CTSW	P56202	376 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	PIP4K2B	P78356	416 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	BNIP3	Q12983	259 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	OGFOD1	Q8N543	542 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	DLGAP3	O95886	979 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CD8B	P10966	210 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	RASA1	P20936	1047 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	NLRP13	Q86W25	1043 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	CEP120	Q8N960	986 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	IL27	Q8NEV9	243 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-287	ENST00000637500	MYO19	Q96H55	970 aa		3	□□□□□ -1.93

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