RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	MS4A1	P11836	297 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	EPHX2	P34913	555 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	WDR90	Q96KV7	1748 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	PODN	Q7Z5L7	613 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	COA1	Q9GZY4	146 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	PDE8B	O95263	885 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	GYG1	P46976	350 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	MTX1	Q13505	466 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CD209	Q9NNX6	404 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	COPRS	Q9NQ92	184 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	USP17L3	A6NCW0	530 aa		18.86	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	USP17L4	A6NCW7	530 aa		18.86	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	ATP8B2	P98198	1209 aa		18.86	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		18.86	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	MICALL2	Q8IY33	904 aa		18.86	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CIAO1	O76071	339 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	GTF2I	P78347	998 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	FGFR2	P21802	821 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	PDE3A	Q14432	1141 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	DACT2	Q5SW24	774 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CEP85	Q6P2H3	762 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ARID1B-222	ENST00000637003		H7C1D1	291 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	EGFR	P00533	1210 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	BCAM	P50895	628 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	TFCP2	Q12800	502 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	POLA2	Q14181	598 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	IL1R1	P14778	569 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	CHADL	Q6NUI6	762 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	SSH3	Q8TE77	659 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	DPF2	Q92785	391 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	SCN9A	Q15858	1988 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC5A1	P13866	664 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	ATP2B3	Q16720	1220 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	LPIN2	Q92539	896 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	GML	Q99445	158 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	ADORA1	P30542	326 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	TIMM10	P62072	90 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	FSTL1	Q12841	308 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1B0GUL6	1792 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003		F8W031	263 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	SASH1	O94885	1247 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	CERS5	Q8N5B7	392 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	USP17L8	P0C7I0	530 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	HTRA3	P83110	453 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
ARID1B-222	ENST00000637003	SCN4A	P35499	1836 aa		18.77	■□□□□ 0.6

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