RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636351.1

CLN3-247, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-247ENST00000636351 CTSWP56202 376 aa22.42■■□□□ 1.18
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CLN3-247ENST00000636351 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CLN3-247ENST00000636351 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN3-247ENST00000636351 CA12O43570 354 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN3-247ENST00000636351 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.41■■□□□ 1.18
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CLN3-247ENST00000636351 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.4■■□□□ 1.18
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CLN3-247ENST00000636351 USP17L8P0C7I0 530 aa22.29■■□□□ 1.16
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CLN3-247ENST00000636351 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN3-247ENST00000636351 PSME4Q14997 1843 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN3-247ENST00000636351 SPEF2Q9C093 1822 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN3-247ENST00000636351 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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CLN3-247ENST00000636351 RGS19P49795 217 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN3-247ENST00000636351 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN3-247ENST00000636351 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.25■■□□□ 1.15
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