RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC30Q5VVM6 783 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 APAF1O14727 1248 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf58Q8NAV2 365 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP4AQ9BY43 222 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 MINPP1Q9UNW1 487 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CCT4P50991 539 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 DACT2Q5SW24 774 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 GREM2Q9H772 168 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SASH1O94885 1247 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 NEXNQ0ZGT2 675 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL11Q8NHH1 800 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO3BQ8WXR4 1341 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT10BO00744 389 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKG1Q13976 671 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 STRIP1Q5VSL9 837 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 COA1Q9GZY4 146 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PI4KAP2A4QPH2 592 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV5-2P06315 115 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 KSR2Q6VAB6 950 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PSME4Q14997 1843 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR25O00155 361 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SREBF2Q12772 1141 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC9Q7Z3E5 817 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TM4SF4P48230 202 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 STK31Q9BXU1 1019 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 LEMD3Q9Y2U8 911 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL5Q6EMB2 1281 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNRD3Q86VQ6 643 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0825Q8IV33 1275 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPYL6Q8N831 410 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ4P48050 445 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF804BA4D1E1 1349 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NEURL1BA8MQ27 555 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FKTNO75072 461 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MPHOSPH8Q99549 860 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD2Q9GZV1 360 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 KLRK1P26718 216 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP14P50281 582 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2IP78347 998 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGA6P23229 1130 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SPEF2Q9C093 1822 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRYD7Q5W111 196 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C1W4 665 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD1Q9UP38 647 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 DLGAP5Q15398 846 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH1A1P00352 501 aa35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 LDLRAD1Q5T700 205 aa35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 G2E3Q7L622 706 aa35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC10A4Q96EP9 437 aa35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CFHR5Q9BXR6 569 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB129Q9H1M3 183 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A2P04920 1241 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNDQ07001 517 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 GCKRQ14397 625 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G12BQ9BX93 195 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH16Q9H6N6 1097 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CD209Q9NNX6 404 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM17Q9Y577 477 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 F8W031 263 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH3P11055 1940 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO1BO43795 1136 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 INHBEP58166 350 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNL1Q8IU54 200 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CLRN2A0PK11 232 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FLIIQ13045 1269 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 WNK4Q96J92 1243 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CLMNQ96JQ2 1002 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 VEZTQ9HBM0 779 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP3Q9Y3E7 222 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAP23O00161 211 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF5LO75529 589 aa34.92■■■■□ 3.18
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