RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SMC5Q8IY18 1101 aa10.5□□□□□ -0.73
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SGMS1-211ENST00000626236 SKAP1Q86WV1 359 aa10.43□□□□□ -0.74
SGMS1-211ENST00000626236 GPATCH3Q96I76 525 aa10.43□□□□□ -0.74
SGMS1-211ENST00000626236 COL4A5P29400 1685 aa10.43□□□□□ -0.74
SGMS1-211ENST00000626236 PSME4Q14997 1843 aa10.42□□□□□ -0.74
SGMS1-211ENST00000626236 MX1P20591 662 aa10.42□□□□□ -0.74
SGMS1-211ENST00000626236 PDE4AP27815 886 aa10.42□□□□□ -0.74
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