RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 DOK7Q18PE1 504 aa26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 KAZALD1Q96I82 304 aa26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 CXCL9Q07325 125 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 SPEF2Q9C093 1822 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 HMMRO75330 724 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 RAD17O75943 681 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 TNIP1Q15025 636 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 HACL1Q9UJ83 578 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 HSPA6P17066 643 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 SCN4AP35499 1836 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 GNAI3P08754 354 aa26.36■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.36■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 KCNJ4P48050 445 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 CHRNDQ07001 517 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 ECE2O60344 883 aa26.34■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 GNAI2P04899 355 aa26.34■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 LTBP1Q14766 1721 aa26.34■■□□□ 1.81
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SGMS1-210ENST00000619438 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.34■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
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SGMS1-210ENST00000619438 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.33■■□□□ 1.81
SGMS1-210ENST00000619438 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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SGMS1-210ENST00000619438 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 FSTL1Q12841 308 aa26.32■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.32■■□□□ 1.8
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SGMS1-210ENST00000619438 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.31■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.3■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 POTEIP0CG38 1075 aa26.29■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 POTEJP0CG39 1038 aa26.29■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 SCNN1DP51172 638 aa26.29■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 PSMD14O00487 310 aa26.28■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 EPS15P42566 896 aa26.28■■□□□ 1.8
SGMS1-210ENST00000619438 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
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SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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SGMS1-210ENST00000619438 ATP8B2P98198 1209 aa26.25■■□□□ 1.79
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SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.25■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.25■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 LDHDQ86WU2 507 aa26.25■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.25■■□□□ 1.79
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SGMS1-210ENST00000619438 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
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SGMS1-210ENST00000619438 APLP1P51693 650 aa26.24■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.24■■□□□ 1.79
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SGMS1-210ENST00000619438 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.23■■□□□ 1.79
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SGMS1-210ENST00000619438 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 DPF2Q92785 391 aa26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L3A6NCW0 530 aa26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L4A6NCW7 530 aa26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-210ENST00000619438 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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SGMS1-210ENST00000619438 MICALL2Q8IY33 904 aa26.2■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.2■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 UBE4AQ14139 1066 aa26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 SCN9AQ15858 1988 aa26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 SNX21Q969T3 373 aa26.19■■□□□ 1.78
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