RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616761.1

TTLL9-209, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 9, human

TSL 5

Gene TTLL9, Length 1,808 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL9-209	ENST00000616761	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	RFC4	P35249	363 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	GCKR	Q14397	625 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	HLF	Q16534	295 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	MYD88	Q99836	296 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	GYS1	P13807	737 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	ZPR1	O75312	459 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	MMP10	P09238	476 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	HSPA4	P34932	840 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	TCHH	Q07283	1943 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	RAD50	Q92878	1312 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.77	□□□□□ -0.2
TTLL9-209	ENST00000616761	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	TM4SF1	P30408	202 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	UBE2H	P62256	183 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	TTC14	Q96N46	770 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	NFIX	Q14938	502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	LAMB2	P55268	1798 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SGSM2	O43147	1006 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	PIM2	Q9P1W9	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SASH1	O94885	1247 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	TPM3	P06753	285 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	GPT	P24298	496 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	AACS	Q86V21	672 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761		H7C1W4	665 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	DDR1	Q08345	913 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21

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