RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.08■□□□□ 0.17
HPS1-215ENST00000613394 KIF18AQ8NI77 898 aa16.08■□□□□ 0.17
HPS1-215ENST00000613394 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.08■□□□□ 0.17
HPS1-215ENST00000613394 ITSN1Q15811 1721 aa16.08■□□□□ 0.17
HPS1-215ENST00000613394 A0A1B0GUL7 405 aa16.08■□□□□ 0.16
HPS1-215ENST00000613394 ERICH4A6NGS2 130 aa16.08■□□□□ 0.16
HPS1-215ENST00000613394 MNS1Q8NEH6 495 aa16.08■□□□□ 0.16
HPS1-215ENST00000613394 ZNF710Q8N1W2 664 aa16.08■□□□□ 0.16
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HPS1-215ENST00000613394 ZNF213O14771 459 aa16.07■□□□□ 0.16
HPS1-215ENST00000613394 PRC1O43663 620 aa16.07■□□□□ 0.16
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HPS1-215ENST00000613394 DCAF5Q96JK2 942 aa16.01■□□□□ 0.15
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HPS1-215ENST00000613394 ZAP70P43403 619 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.152e-7■■■□□ 14.6
HPS1-215ENST00000613394 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16■□□□□ 0.15
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HPS1-215ENST00000613394 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 NEMFO60524 1076 aa16■□□□□ 0.15
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HPS1-215ENST00000613394 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 TRERF1Q96PN7 1200 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 HELLSQ9NRZ9 838 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 UBASH3AP57075 661 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 JMYQ8N9B5 988 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 CNNM3Q8NE01 707 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 UBXN4Q92575 508 aa15.99■□□□□ 0.15
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