RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BARGINQ6ZT62 677 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APPBP2Q92624 585 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NRAPQ86VF7 1730 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHLPP1O60346 1717 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDE8BO95263 885 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SIK1P57059 783 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCARF1Q14162 830 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BRF1Q92994 677 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 E7EWF7 191 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PARP10Q53GL7 1025 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLHL34Q8N239 644 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUP98P52948 1817 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT85P78386 507 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSPY26PQ9H489 355 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PFKFB2O60825 505 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DTNBO60941 627 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MCAMP43121 646 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SUSD4Q5VX71 490 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LPIN2Q92539 896 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH3P11055 1940 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF3AQ9Y496 699 aa22■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CAMTA2O94983 1202 aa22■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCRN1Q12765 414 aa22■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBXL16Q8N461 479 aa22■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM184AQ8NB25 1140 aa22■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITPK1Q13572 414 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ELP1O95163 1332 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLIT2O94813 1529 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 JAK2O60674 1132 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOM1O60784 492 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC102BQ68D86 513 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PI16Q6UXB8 463 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FERMT3Q86UX7 667 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCHHQ07283 1943 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADD2P35612 726 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H3BQV1 296 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPAA1O43292 621 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FGAP02671 866 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC5A1P13866 664 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FGFR2P21802 821 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APOBRQ0VD83 1088 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IFFO2Q5TF58 517 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRP5O75197 1615 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A0G2JLW4 131 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ESPNB1AK53 854 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE3CQ15386 1083 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOXP2O15409 715 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RREB1Q92766 1687 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHKA1P46020 1223 aa21.95■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RTL9Q8NET4 1388 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM177BA6PVY3 158 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF213O14771 459 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATRNO75882 1429 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MCM5P33992 734 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EVCP57679 992 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PIP4K2BP78356 416 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTC6Q86TZ1 520 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX11Q96FC9 970 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms