RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, human

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USF2-215	ENST00000602164	PLIN1	O60240	522 aa		33.51	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		33.51	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	COA1	Q9GZY4	146 aa		33.51	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	EYA2	O00167	538 aa		33.5	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	FSTL1	Q12841	308 aa		33.49	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	UBE4A	Q14139	1066 aa		33.49	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		33.49	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		33.49	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	FBXO3	Q9UK99	471 aa		33.48	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.47	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	DPF2	Q92785	391 aa		33.47	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	COPRS	Q9NQ92	184 aa		33.47	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	SHTN1	A0MZ66	631 aa		33.46	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	CIAO1	O76071	339 aa		33.46	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	MS4A1	P11836	297 aa		33.46	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	SRGAP3	O43295	1099 aa		33.45	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	PDE8B	O95263	885 aa		33.45	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	LDHD	Q86WU2	507 aa		33.45	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	CD209	Q9NNX6	404 aa		33.45	■■■□□ 2.95
USF2-215	ENST00000602164	USP17L3	A6NCW0	530 aa		33.44	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	USP17L4	A6NCW7	530 aa		33.44	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		33.44	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	SIL1	Q9H173	461 aa		33.44	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		33.43	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	CHADL	Q6NUI6	762 aa		33.43	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	GML	Q99445	158 aa		33.43	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	FGFR2	P21802	821 aa		33.42	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	DACT2	Q5SW24	774 aa		33.42	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	MICALL2	Q8IY33	904 aa		33.42	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		33.42	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	IL1R1	P14778	569 aa		33.41	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		33.41	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		33.4	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		33.4	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	HSPA6	P17066	643 aa		33.39	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		33.39	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		33.39	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
USF2-215	ENST00000602164	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	GYG1	P46976	350 aa		33.38	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	POLA2	Q14181	598 aa		33.38	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	COG6	Q9Y2V7	657 aa		33.38	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	PDE3A	Q14432	1141 aa		33.37	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	MXD3	Q9BW11	206 aa		33.37	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	ATP8B2	P98198	1209 aa		33.36	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	SSH3	Q8TE77	659 aa		33.36	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164		H7C1D1	291 aa		33.35	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	EGFR	P00533	1210 aa		33.35	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	GTF2I	P78347	998 aa		33.35	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		33.35	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.35	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		33.35	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		33.34	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		33.34	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		33.33	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	FBXW7	Q969H0	707 aa		33.33	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		33.33	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		33.32	■■■□□ 2.93
USF2-215	ENST00000602164	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	CEP85	Q6P2H3	762 aa		33.32	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	LPIN2	Q92539	896 aa		33.32	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		33.32	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		33.32	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	CERS5	Q8N5B7	392 aa		33.31	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		33.3	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	PASK	Q96RG2	1323 aa		33.3	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	USP17L8	P0C7I0	530 aa		33.3	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	ATP2B3	Q16720	1220 aa		33.3	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	SASH1	O94885	1247 aa		33.29	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	SLC5A1	P13866	664 aa		33.29	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	BCAM	P50895	628 aa		33.28	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	CNTROB	Q8N137	903 aa		33.28	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	TFCP2	Q12800	502 aa		33.27	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		33.27	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		33.27	■■■□□ 2.92
USF2-215	ENST00000602164	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms