RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	UFL1	O94874	794 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPND	Q8N594	471 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERC2	O15083	957 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHKA1	P46020	1223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	GYG1	P46976	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	AOX1	Q06278	1338 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCAM	P50895	628 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP5J	P18859	108 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCARF1	Q14162	830 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	SDS	P20132	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCAM	P43121	646 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	HAUS7	Q99871	368 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLIM4	O00461	696 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZAP70	P43403	619 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	EYA3	Q99504	573 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMD1	Q99460	953 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	AOC3	Q16853	763 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFKBIE	O00221	500 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEMA3E	O15041	775 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL1R1	P14778	569 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.12	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms