RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 PSME4Q14997 1843 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 G3V3G9 751 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 DOK7Q18PE1 504 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 YDJCA8MPS7 323 aa24.96■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 KLRK1P26718 216 aa24.96■■□□□ 1.59
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ATG4D-208ENST00000588667 GPC2Q8N158 579 aa24.95■■□□□ 1.58
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ATG4D-208ENST00000588667 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.94■■□□□ 1.58
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ATG4D-208ENST00000588667 SCN4AP35499 1836 aa24.93■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.93■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 RAD17O75943 681 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 TNIP1Q15025 636 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 FGFR2P21802 821 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
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ATG4D-208ENST00000588667 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 HMMRO75330 724 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4D-208ENST00000588667 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.9■■□□□ 1.58
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ATG4D-208ENST00000588667 CD209Q9NNX6 404 aa24.89■■□□□ 1.57
ATG4D-208ENST00000588667 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.89■■□□□ 1.57
ATG4D-208ENST00000588667 PSMD14O00487 310 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-208ENST00000588667 SLC5A1P13866 664 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4D-208ENST00000588667 ATP2B3Q16720 1220 aa24.88■■□□□ 1.57
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ATG4D-208ENST00000588667 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
ATG4D-208ENST00000588667 TFCP2Q12800 502 aa24.87■■□□□ 1.57
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ATG4D-208ENST00000588667 USP17L4A6NCW7 530 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4D-208ENST00000588667 POTECB2RU33 542 aa24.86■■□□□ 1.57
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ATG4D-208ENST00000588667 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.85■■□□□ 1.57
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ATG4D-208ENST00000588667 VPS37DQ86XT2 251 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-208ENST00000588667 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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ATG4D-208ENST00000588667 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4D-208ENST00000588667 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.83■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.83■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
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ATG4D-208ENST00000588667 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.82■■□□□ 1.56
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ATG4D-208ENST00000588667 DACT2Q5SW24 774 aa24.81■■□□□ 1.56
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ATG4D-208ENST00000588667 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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ATG4D-208ENST00000588667 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 ADORA1P30542 326 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 EPS15P42566 896 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 TNNI3KQ59H18 835 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 GMLQ99445 158 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4D-208ENST00000588667 MICALL2Q8IY33 904 aa24.77■■□□□ 1.56
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