RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR90Q96KV7 1748 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GUL6 1792 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 TOMM70O94826 608 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 METTL24Q5JXM2 366 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 SIL1Q9H173 461 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 COG6Q9Y2V7 657 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 SCN4AP35499 1836 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMD14O00487 310 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 SRGAP3O43295 1099 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 KLRK1P26718 216 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 EPS15P42566 896 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 C1QTNF8P60827 252 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXW7Q969H0 707 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 HACL1Q9UJ83 578 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 EYA2O00167 538 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE8BO95263 885 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 POTEIP0CG38 1075 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 POTEJP0CG39 1038 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 EPHX2P34913 555 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP8B2P98198 1209 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE4AQ14139 1066 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 PODNQ7Z5L7 613 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 COA1Q9GZY4 146 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 SCN9AQ15858 1988 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 MED23Q9ULK4 1368 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-211ENST00000588374 SHTN1A0MZ66 631 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L3A6NCW0 530 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L4A6NCW7 530 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 H7C1D1 291 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 GYG1P46976 350 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SCNN1DP51172 638 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF2IP78347 998 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 MXD3Q9BW11 206 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CD209Q9NNX6 404 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 COPRSQ9NQ92 184 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 TIMM10P62072 90 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.064e-7■■■□□ 17.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MTX1Q13505 466 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE3AQ14432 1141 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 PSME4Q14997 1843 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CIAO1O76071 339 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 BCAMP50895 628 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 TFCP2Q12800 502 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CHADLQ6NUI6 762 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS37DQ86XT2 251 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 MICALL2Q8IY33 904 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 DPF2Q92785 391 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO3Q9UK99 471 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 JAG2Q9Y219 1238 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SASH1O94885 1247 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC5A1P13866 664 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 IL1R1P14778 569 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 FGFR2P21802 821 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms