RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575237.2

CREBBP-211, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene CREBBP, Length 403 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-211ENST00000575237 MED23Q9ULK4 1368 aa18.23■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 INHBEP58166 350 aa18.23■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 MXD3Q9BW11 206 aa18.23■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.23■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 MYO3BQ8WXR4 1341 aa18.23■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 PDE8AO60658 829 aa18.22■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 IFNL1Q8IU54 200 aa18.22■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.22■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 SZT2Q5T011 3432 aa18.22■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.21■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.21■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 ARMC5Q96C12 935 aa18.21■□□□□ 0.51
CREBBP-211ENST00000575237 SASH1O94885 1247 aa18.2■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 PRKG1Q13976 671 aa18.2■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.2■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.2■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 GOLGA2Q08379 1002 aa18.19■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 MAP3K11Q16584 847 aa18.19■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.19■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 ERO1AQ96HE7 468 aa18.19■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 EN2P19622 333 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 MYD88Q99836 296 aa18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 COA1Q9GZY4 146 aa18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 WNK4Q96J92 1243 aa18.17■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 UNCXA6NJT0 531 aa18.16■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 NEUROD2Q15784 382 aa18.16■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 CD99L2Q8TCZ2 262 aa18.16■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 FBXW7Q969H0 707 aa18.16■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 FZD1Q9UP38 647 aa18.16■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 LAMB1P07942 1786 aa18.16■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.15■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.15■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.15■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 EFCC1Q9HA90 598 aa18.15■□□□□ 0.5
CREBBP-211ENST00000575237 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.14■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 CTSWP56202 376 aa18.14■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 CRHR2Q13324 411 aa18.14■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.14■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.14■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 CAP1Q01518 475 aa18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF333Q96JL9 665 aa18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 A0A0C4DFX4 3053 aa18.13■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 GJA5P36382 358 aa18.12■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 SP3Q02447 781 aa18.12■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.12■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.12■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 GREM2Q9H772 168 aa18.12■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 MBIPQ9NS73 344 aa18.12■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.11■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.1■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.1■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 GTF2IP78347 998 aa18.1■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 DLGAP5Q15398 846 aa18.1■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 RUNDC1Q96C34 613 aa18.1■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 PTPN18Q99952 460 aa18.1■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF853P0CG23 659 aa18.09■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 KLRK1P26718 216 aa18.09■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.09■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CREBBP-211ENST00000575237 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 IGKV5-2P06315 115 aa18.08■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 OTUD5Q96G74 571 aa18.08■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 SPEF2Q9C093 1822 aa18.07■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 RALBP1Q15311 655 aa18.07■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 NBPF11Q86T75 865 aa18.07■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 CERS5Q8N5B7 392 aa18.07■□□□□ 0.48
CREBBP-211ENST00000575237 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms