RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 METTL24Q5JXM2 366 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 GREM2Q9H772 168 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD1Q15327 319 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ATP2B3Q16720 1220 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 XAGE2Q96GT9 111 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 SYNE4Q8N205 404 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 BRD1O95696 1058 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 PKP1Q13835 747 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 SUSD4Q5VX71 490 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 TM4SF1P30408 202 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 SETDB2Q96T68 719 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 NFIXQ14938 502 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 MCTP1Q6DN14 999 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 MYH7P12883 1935 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 RTL9Q8NET4 1388 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 RPS6KB1P23443 525 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 ADORA1P30542 326 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 CPA1P15085 419 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 NTSR2O95665 410 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 PDE8BO95263 885 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-204ENST00000575194 FAM177BA6PVY3 158 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 NEK1Q96PY6 1258 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 MAST3O60307 1309 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 LPIN2Q92539 896 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 DDR1Q08345 913 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 NYXQ9GZU5 481 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 SLC5A1P13866 664 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 FSD2A1L4K1 749 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 LARGE1O95461 756 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 ZAP70P43403 619 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 APPBP2Q92624 585 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 CYP21A2P08686 494 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 ME3Q16798 604 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 ERFEQ4G0M1 354 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 MSL1Q68DK7 614 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS3-204ENST00000575194 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.23■■□□□ 1.15
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