RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FGFR2	P21802	821 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	40.98	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	COA1	Q9GZY4	146 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	YDJC	A8MPS7	323 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LPIN2	Q92539	896 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		40.97	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TFCP2	Q12800	502 aa		40.97	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PODN	Q7Z5L7	613 aa		40.97	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	40.96	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		40.96	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SASH1	O94885	1247 aa		40.95	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		40.95	■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SLC5A1	P13866	664 aa		40.94	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ATP2B3	Q16720	1220 aa		40.94	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		40.94	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		40.94	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SCN9A	Q15858	1988 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	40.93	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CXCL9	Q07325	125 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GPC2	Q8N158	579 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		40.91	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		40.91	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CD209	Q9NNX6	404 aa		40.91	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RAD17	O75943	681 aa		40.9	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PSME4	Q14997	1843 aa		40.9	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GYG1	P46976	350 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TNIP1	Q15025	636 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		40.88	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.14
CTDNEP1-209	ENST00000574205		A0A1B0GUL7	405 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IL1R1	P14778	569 aa		40.87	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	VPS37D	Q86XT2	251 aa		40.87	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GPR108	Q9NPR9	543 aa		40.87	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		40.87	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF609	O15014	1411 aa		40.86	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		40.86	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	WDR90	Q96KV7	1748 aa		40.85	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TIMM10	P62072	90 aa		40.85	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RAB11FIP3	O75154	756 aa		40.84	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	40.84	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PSMD14	O00487	310 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BCAM	P50895	628 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CTDNEP1-209	ENST00000574205	USP17L3	A6NCW0	530 aa		40.82	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	USP17L4	A6NCW7	530 aa		40.82	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TNNI3K	Q59H18	835 aa		40.82	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		40.82	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		40.82	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		40.82	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		40.81	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DCTPP1	Q9H773	170 aa		40.81	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		40.79	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	XAGE2	Q96GT9	111 aa		40.79	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ADORA1	P30542	326 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	40.78	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SCN4A	P35499	1836 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	APBB1	O00213	710 aa		40.77	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GTF2I	P78347	998 aa		40.77	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		40.77	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FBXW7	Q969H0	707 aa		40.76	■■■■■ 4.12
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SCNN1D	P51172	638 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DACT2	Q5SW24	774 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	RRAGC	Q9HB90	399 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CCDC102B	Q68D86	513 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	40.74	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	POTEC	B2RU33	542 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PHKA1	P46020	1223 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DPF2	Q92785	391 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GORAB	Q5T7V8	394 aa		40.72	■■■■■ 4.11

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