RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 PRKG1Q13976 671 aa22.67■■□□□ 1.22
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CCDC40-211ENST00000574099 WNT10BO00744 389 aa22.65■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 TM4SF4P48230 202 aa22.65■■□□□ 1.22
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CCDC40-211ENST00000574099 GTF2IP78347 998 aa22.55■■□□□ 1.2
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CCDC40-211ENST00000574099 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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CCDC40-211ENST00000574099 STK31Q9BXU1 1019 aa22.48■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 CD209Q9NNX6 404 aa22.48■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 SNAP23O00161 211 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 INHBEP58166 350 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 CHRNDQ07001 517 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC40-211ENST00000574099 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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