RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568721.1

KCTD13-208, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 13, human

TSL 2

Gene KCTD13, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCTD13-208	ENST00000568721	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	PLIN1	O60240	522 aa		27.65	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	GNAI3	P08754	354 aa		27.65	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	KCNJ4	P48050	445 aa		27.64	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.64	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		27.64	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	ZNF609	O15014	1411 aa		27.64	■■■□□ 2.02
KCTD13-208	ENST00000568721	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.63	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.62	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	GML	Q99445	158 aa		27.62	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.61	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.61	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	MTX1	Q13505	466 aa		27.61	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.61	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.61	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.61	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.61	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	EYA2	O00167	538 aa		27.6	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.6	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.6	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		27.6	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.59	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.59	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.59	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721		H7C1D1	291 aa		27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	PDE8B	O95263	885 aa		27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	EGFR	P00533	1210 aa		27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	APLP1	P51693	650 aa		27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.58	■■■□□ 2.01
KCTD13-208	ENST00000568721	GNAI2	P04899	355 aa		27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	IL1R1	P14778	569 aa		27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.56	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	PANK1	Q8TE04	598 aa		27.56	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	CIAO1	O76071	339 aa		27.55	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	FGFR2	P21802	821 aa		27.55	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	HTRA3	P83110	453 aa		27.55	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.55	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	GTF2I	P78347	998 aa		27.54	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.54	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		27.54	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	SIL1	Q9H173	461 aa		27.54	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.53	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	GYG1	P46976	350 aa		27.53	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.53	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.52	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		27.52	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
KCTD13-208	ENST00000568721	CEP350	Q5VT06	3117 aa		27.51	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.5	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.5	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.49	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	SASH1	O94885	1247 aa		27.49	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.49	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.49	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.48	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.48	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.48	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.47	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	MS4A1	P11836	297 aa		27.47	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	POLA2	Q14181	598 aa		27.47	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.47	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.47	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	LPIN2	Q92539	896 aa		27.46	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.46	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.46	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.45	■■□□□ 1.99
KCTD13-208	ENST00000568721	TRAF5	O00463	557 aa		27.45	■■□□□ 1.98
KCTD13-208	ENST00000568721	BCAM	P50895	628 aa		27.45	■■□□□ 1.98
KCTD13-208	ENST00000568721	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.45	■■□□□ 1.98
KCTD13-208	ENST00000568721	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	27.45	■■□□□ 1.98

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