RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565483.1

STX4-215, Transcript of syntaxin 4, human

TSL 5

Gene STX4, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX4-215	ENST00000565483	CSF1R	P07333	972 aa		27.77	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	KLRK1	P26718	216 aa		27.77	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	SCARF1	Q14162	830 aa		27.77	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	GML	Q99445	158 aa		27.77	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		27.77	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.76	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	BEND3	Q5T5X7	828 aa		27.76	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	SULF1	Q8IWU6	871 aa		27.76	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.76	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	MAP2K2	P36507	400 aa		27.75	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.75	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.75	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		27.74	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		27.74	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	ZNF609	O15014	1411 aa		27.74	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	CACNA1F	O60840	1977 aa		27.73	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		27.73	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	FOXO4	P98177	505 aa		27.73	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.73	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.73	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	PSME4	Q14997	1843 aa		27.73	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	SNAP23	O00161	211 aa		27.72	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	KCNJ4	P48050	445 aa		27.72	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	CHRND	Q07001	517 aa		27.72	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.72	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		27.72	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		27.71	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		27.71	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	CDCA5	Q96FF9	252 aa		27.71	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.71	■■■□□ 2.03
STX4-215	ENST00000565483	TAF5L	O75529	589 aa		27.7	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		27.69	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		27.68	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	RGMB	Q6NW40	437 aa		27.68	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	GRM8	O00222	908 aa		27.67	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.67	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	ZNF521	Q96K83	1311 aa		27.67	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	GTF2I	P78347	998 aa		27.66	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	NOG	Q13253	232 aa		27.66	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.66	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	SASH1	O94885	1247 aa		27.65	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		27.65	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		27.65	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.65	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	PLIN1	O60240	522 aa		27.64	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.64	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.64	■■■□□ 2.02
STX4-215	ENST00000565483	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		27.63	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.63	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.63	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	ALDH1L1	O75891	902 aa		27.62	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.62	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		27.62	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	WNT10B	O00744	389 aa		27.61	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	CCDC102A	Q96A19	550 aa		27.61	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.61	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.61	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	CA12	O43570	354 aa		27.6	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		27.6	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		27.6	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.6	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	SLC10A3	P09131	477 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
STX4-215	ENST00000565483		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.58	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.57	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.57	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.57	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		27.57	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		27.56	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483		E9PSI1	815 aa		27.55	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		27.55	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.54	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		27.54	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.54	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	FKBP1B	P68106	108 aa		27.53	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		27.53	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		27.53	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	IL1R1	P14778	569 aa		27.52	■■■□□ 2
STX4-215	ENST00000565483	SLFN5	Q08AF3	891 aa		27.52	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms