RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 USP17L8P0C7I0 530 aa28.45■■■□□ 2.14
CLN3-215ENST00000565236 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CLN3-215ENST00000565236 SLFN5Q08AF3 891 aa28.45■■■□□ 2.14
CLN3-215ENST00000565236 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.45■■■□□ 2.14
CLN3-215ENST00000565236 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.45■■■□□ 2.14
CLN3-215ENST00000565236 WBP1LQ9NX94 342 aa28.45■■■□□ 2.14
CLN3-215ENST00000565236 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CLN3-215ENST00000565236 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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CLN3-215ENST00000565236 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.41■■■□□ 2.14
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CLN3-215ENST00000565236 OGFOD1Q8N543 542 aa28.39■■■□□ 2.14
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CLN3-215ENST00000565236 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
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CLN3-215ENST00000565236 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
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CLN3-215ENST00000565236 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.3■■■□□ 2.12
CLN3-215ENST00000565236 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.3■■■□□ 2.12
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CLN3-215ENST00000565236 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
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CLN3-215ENST00000565236 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.24■■■□□ 2.11
CLN3-215ENST00000565236 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.23■■■□□ 2.11
CLN3-215ENST00000565236 CA12O43570 354 aa28.22■■■□□ 2.11
CLN3-215ENST00000565236 FKBP1BP68106 108 aa28.22■■■□□ 2.11
CLN3-215ENST00000565236 CERS5Q8N5B7 392 aa28.22■■■□□ 2.11
CLN3-215ENST00000565236 DLGAP5Q15398 846 aa28.21■■■□□ 2.11
CLN3-215ENST00000565236 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.21■■■□□ 2.11
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