RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 CIAO1O76071 339 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 SCNN1DP51172 638 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 UBE4AQ14139 1066 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 FBXO3Q9UK99 471 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 G3V3G9 751 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDE8BO95263 885 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 TNIP1Q15025 636 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF609O15014 1411 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 POLA2Q14181 598 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 CEP85Q6P2H3 762 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 PODNQ7Z5L7 613 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 SSH3Q8TE77 659 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 COA1Q9GZY4 146 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 HACL1Q9UJ83 578 aa23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 FGFR2P21802 821 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATP8B2P98198 1209 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 EPHX2P34913 555 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 EPS15P42566 896 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 CD209Q9NNX6 404 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 SHTN1A0MZ66 631 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 TOMM70O94826 608 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 POTEIP0CG38 1075 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 POTEJP0CG39 1038 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 GYG1P46976 350 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP17L3A6NCW0 530 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP17L4A6NCW7 530 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 IL1R1P14778 569 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 DACT2Q5SW24 774 aa23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 MXD3Q9BW11 206 aa23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 C1QTNF8P60827 252 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATP2B3Q16720 1220 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 LPIN2Q92539 896 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 DPF2Q92785 391 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 GMLQ99445 158 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 TFCP2Q12800 502 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 MICALL2Q8IY33 904 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 FBXW7Q969H0 707 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-209ENST00000561191 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLC5A1P13866 664 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 GTF2IP78347 998 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 SASH1O94885 1247 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRPM4Q8TD43 1214 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 BCAMP50895 628 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 LDHDQ86WU2 507 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 JAG2Q9Y219 1238 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 EGFRP00533 1210 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADORA1P30542 326 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 VPS37DQ86XT2 251 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 CERS5Q8N5B7 392 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 A0A1B0GUL7 405 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 CRBNQ96SW2 442 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms