RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHA1	P21709	976 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	HYAL2	Q12891	473 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	FDX2	Q6P4F2	183 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT8B	Q93098	351 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	SPACA7	Q96KW9	195 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	WEE1	P30291	646 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL6	Q8N531	539 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	MEGF11	A6BM72	1044 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	POM121C	A8CG34	1229 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	LGR5	O75473	907 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF4A	O95239	1232 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC25B	P30305	580 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	PIP4K2B	P78356	416 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF124	Q15973	351 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	FLCN	Q8NFG4	579 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM19	Q9H013	955 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BRJ5	948 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRA	P18433	802 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	DPYD	Q12882	1025 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	PTK7	Q13308	1070 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	SGO2	Q562F6	1265 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM177B	A6PVY3	158 aa		5.62	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP26A1	O43174	497 aa		5.62	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	PBX4	Q9BYU1	374 aa		5.62	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	BIN1	O00499	593 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	RXRB	P28702	533 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	POM121	Q96HA1	1249 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYND15	Q9H091	742 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	TIAF1	O95411	115 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	CABP4	P57796	275 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	PKN1	Q16512	942 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	PAOX	Q6QHF9	649 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	SHISA5	Q8N114	240 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP120	Q8N960	986 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM196B	A6NMK8	535 aa		5.59	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	SCNN1A	P37088	669 aa		5.59	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP12	P59046	1061 aa		5.59	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	COX20	Q5RI15	118 aa		5.59	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	ZAR1	Q86SH2	424 aa		5.59	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		5.59	□□□□□ -1.51
AKAP13-223	ENST00000560957	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L15	C9J2P7	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L10	C9JJH3	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L12	C9JPN9	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L11	C9JVI0	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L21	D6R901	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L18	D6R9N7	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L22	D6RA61	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L19	D6RCP7	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L20	D6RJB6	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD21	O60216	631 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ADM	P35318	185 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L24	Q0WX57	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	NFKBIB	Q15653	356 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	GATA6	Q92908	595 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	KSR1	Q8IVT5	923 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52

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