RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC102AQ96A19 550 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 XDHP47989 1333 aa25.33■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 BCAR3O75815 825 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 CSF1RP07333 972 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 RGMBQ6NW40 437 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 SULF1Q8IWU6 871 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 GREM2Q9H772 168 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 UTYO14607 1347 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP2B4P23634 1241 aa25.31■■□□□ 1.64
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RABGGTA-210ENST00000559586 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
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RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF609O15014 1411 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 EGFRP00533 1210 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 KAZALD1Q96I82 304 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 PODNQ7Z5L7 613 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 GGA3Q9NZ52 723 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF16BQ96L93 1317 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 ADM5C9JUS6 153 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM161AQ3B820 660 aa25.27■■□□□ 1.64
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RABGGTA-210ENST00000559586 SPEF2Q9C093 1822 aa25.26■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 SUCLG2Q96I99 432 aa25.26■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.26■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 TNNQ9UQP3 1299 aa25.26■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L3A6NCW0 530 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L4A6NCW7 530 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L8P0C7I0 530 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 DLK2Q6UY11 383 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 FKBP1BP68106 108 aa25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 SCARF1Q14162 830 aa25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM27P14373 513 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 ITGA6P23229 1130 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 CDCA5Q96FF9 252 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 GMLQ99445 158 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 SCN9AQ15858 1988 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 MMP14P50281 582 aa25.22■■□□□ 1.63
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RABGGTA-210ENST00000559586 ZIC5Q96T25 663 aa25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 MED23Q9ULK4 1368 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 RGS19P49795 217 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC10A3P09131 477 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 DGKZQ13574 1117 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 OGFOD1Q8N543 542 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 COA1Q9GZY4 146 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 PSME4Q14997 1843 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF186Q9NXI6 227 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 TRPA1O75762 1119 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A1B0GUL6 1792 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 DACT2Q5SW24 774 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 CSRNP1Q96S65 589 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-210ENST00000559586 MEIS3Q99687 375 aa25.14■■□□□ 1.62
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