RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558593.1

GABPB1-AS1-203, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB1-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C4AP0C0L4 1744 aa8.94□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.94□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.94□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.93□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.93□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.93□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.93□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SBF1O95248 1867 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 A6NJR5 290 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FOXN1O15353 648 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SSFA2P28290 1259 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FSTL1Q12841 308 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WASHC4Q2M389 1173 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.91□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MAFGO15525 162 aa8.91□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FBXO45P0C2W1 286 aa8.91□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TMF1P82094 1093 aa8.91□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NR1H3Q13133 447 aa8.91□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.91□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.91□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.91□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TNFRSF10AO00220 468 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IRF5Q13568 498 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CYP4X1Q8N118 509 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ADAM32Q8TC27 787 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRAK2O60296 914 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GDF9O60383 454 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GPR37L1O60883 481 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KCNA3P22001 575 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RFC4P35249 363 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TGFB2P61812 414 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GRM1Q13255 1194 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PIM2Q9P1W9 311 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.89□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CACNA1SQ13698 1873 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GYS1P13807 737 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 VAC14Q08AM6 782 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ARID5BQ14865 1188 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ERFEQ4G0M1 354 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.88□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LBX1P52954 281 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRR20EP86478 221 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRR20CP86479 221 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRR20DP86480 221 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRR20BP86481 221 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRR20AP86496 221 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DDR1Q08345 913 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DCAF5Q96JK2 942 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ATG3Q9NT62 314 aa8.87□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SIAH2O43255 324 aa8.86□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GFRA3O60609 400 aa8.86□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.86□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 AIDAQ96BJ3 306 aa8.86□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ALDH1A1P00352 501 aa8.85□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MCCP23508 829 aa8.85□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.85□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.85□□□□□ -0.99
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms