RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 GMLQ99445 158 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 SULF1Q8IWU6 871 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 VEGFBP49765 207 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 CST9Q5W186 159 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 AIDAQ96BJ3 306 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 KIF16BQ96L93 1317 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 TRAF5O00463 557 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 UBE4AQ14139 1066 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 DACT2Q5SW24 774 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 SUCLG2Q96I99 432 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 CD209Q9NNX6 404 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 SHTN1A0MZ66 631 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 MAP2K2P36507 400 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 USP48Q86UV5 1035 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 FBXW7Q969H0 707 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 USP44Q9H0E7 712 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-212ENST00000557478 IL1R1P14778 569 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 SCARF1Q14162 830 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 KAZALD1Q96I82 304 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 CAPNS2Q96L46 248 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 GGA3Q9NZ52 723 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 TAF5LO75529 589 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 FKBP1BP68106 108 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 IFFO2Q5TF58 517 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 FBXO3Q9UK99 471 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 EGFRP00533 1210 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 GTF2IP78347 998 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 SASH1O94885 1247 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 WBP1LQ9NX94 342 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 SCN9AQ15858 1988 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 CA12O43570 354 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 PLIN1O60240 522 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 PSME4Q14997 1843 aa21.91■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 KLRK1P26718 216 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 METTL24Q5JXM2 366 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 VPS37DQ86XT2 251 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 MIER1Q8N108 512 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC102AQ96A19 550 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD1-212ENST00000557478 NF2P35240 595 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 HUNKP57058 714 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 NOGQ13253 232 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 SPEF2Q9C093 1822 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 WNT10BO00744 389 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 MYO1BO43795 1136 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 PDE8BO95263 885 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 GNAI3P08754 354 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 ADM5C9JUS6 153 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 DLGAP5Q15398 846 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD1-212ENST00000557478 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms