RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553920.5

RBM23-211, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-211	ENST00000553920	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	GREM2	Q9H772	168 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	MYH3	P11055	1940 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	SLC34A2	O95436	690 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	DACT2	Q5SW24	774 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	PODN	Q7Z5L7	613 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920		H7C1W4	665 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	KLRK1	P26718	216 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-211	ENST00000553920	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CASP7	P55210	303 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	WNT10B	O00744	389 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	FKBP1B	P68106	108 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	SNAP23	O00161	211 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CSF1R	P07333	972 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	SOX10	P56693	466 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	GCKR	Q14397	625 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	WWC1	Q8IX03	1113 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	COA1	Q9GZY4	146 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	SASH1	O94885	1247 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	TBC1D8	O95759	1140 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	ITGA6	P23229	1130 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CCDC27	Q2M243	656 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920		A0A1B0GUL6	1792 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	HTT	P42858	3142 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	TM4SF4	P48230	202 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	FLII	Q13045	1269 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	GTF2I	P78347	998 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CHRND	Q07001	517 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	PRKG1	Q13976	671 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CD209	Q9NNX6	404 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	CENPF	P49454	3210 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-211	ENST00000553920	AOX1	Q06278	1338 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	VAMP4	O75379	141 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	TAF5L	O75529	589 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	FOXO4	P98177	505 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	IL16	Q14005	1332 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	GPR25	O00155	361 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-211	ENST00000553920	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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