RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 MCAMP43121 646 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 BCAMP50895 628 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 MASTLQ96GX5 879 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 XDHP47989 1333 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 SGSM2O43147 1006 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 TMC4Q7Z404 712 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 USP26Q9BXU7 913 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 H0YIN7 160 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ALDH1B1P30837 517 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 GYG1P46976 350 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 GPSM2P81274 684 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 PI16Q6UXB8 463 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 VPS37DQ86XT2 251 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 RAD50Q92878 1312 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ATP2B4P23634 1241 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 SPATA5Q8NB90 893 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 FAM227BQ96M60 508 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 IL25Q9H293 177 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 A0A0D9SFI3 127 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 STYK1Q6J9G0 422 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 SLC51AQ86UW1 340 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 TICAM2Q86XR7 235 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 SP8Q8IXZ3 490 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 ZBTB7AO95365 584 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 MCCP23508 829 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 RASGRF1Q13972 1273 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 GGA1Q9UJY5 639 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 UFL1O94874 794 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 KLRK1P26718 216 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 CACNA1SQ13698 1873 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 POLD1P28340 1107 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 CHRNA5P30532 468 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 MTFR1LQ9H019 292 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 CHGBP05060 677 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 CNKSR1Q969H4 720 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 MYH7P12883 1935 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 MED23Q9ULK4 1368 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 C6orf229H3BNL8 230 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 SEMA3EO15041 775 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 WASHC4Q2M389 1173 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 PTH1RQ03431 593 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 MAP3K12Q12852 859 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms