RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 OLFM4Q6UX06 510 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRB-206ENST00000548122 PRKG1Q13976 671 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 AACSQ86V21 672 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 TNNI2P48788 182 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRB-206ENST00000548122 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-206ENST00000548122 MRC1P22897 1456 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 EYA2O00167 538 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-206ENST00000548122 FOSBP53539 338 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 GSE1Q14687 1217 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-206ENST00000548122 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L3A6NCW0 530 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L4A6NCW7 530 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 GPSM2P81274 684 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 AIDAQ96BJ3 306 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 ABCC12Q96J65 1359 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 H7C1W4 665 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRB-206ENST00000548122 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L8P0C7I0 530 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ERC2O15083 957 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
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PTPRB-206ENST00000548122 PODNQ7Z5L7 613 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRB-206ENST00000548122 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 COA1Q9GZY4 146 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
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PTPRB-206ENST00000548122 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
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PTPRB-206ENST00000548122 USP54Q70EL1 1684 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-206ENST00000548122 SCNN1DP51172 638 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 GSTO1P78417 241 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TNFAIP1Q13829 316 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-206ENST00000548122 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-206ENST00000548122 RILPL2Q969X0 211 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM51Q9NW97 253 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 MAP3K12Q12852 859 aa6.63□□□□□ -1.35
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