RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 PSEN2P49810 448 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 GRAPQ13588 217 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.8□□□□□ -1.32
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CS-210ENST00000547912 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 RTL9Q8NET4 1388 aa6.8□□□□□ -1.32
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CS-210ENST00000547912 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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CS-210ENST00000547912 CASP7P55210 303 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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CS-210ENST00000547912 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 SYNE4Q8N205 404 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 USP44Q9H0E7 712 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 C21orf2O43822 256 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 PLIN1O60240 522 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 CSF1RP07333 972 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 ITGA6P23229 1130 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 FOXO4P98177 505 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 SP8Q8IXZ3 490 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 PANK1Q8TE04 598 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 SUCLG2Q96I99 432 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 MEIS3Q99687 375 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 GREM2Q9H772 168 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 COG6Q9Y2V7 657 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-210ENST00000547912 AAMPQ13685 434 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 FAM161AQ3B820 660 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 VPS33BQ9H267 617 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SLX4Q8IY92 1834 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SPEF2Q9C093 1822 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SRGAP3O43295 1099 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 HMMRO75330 724 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 RLBP1P12271 317 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 MPNDQ8N594 471 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 KCNK17Q96T54 332 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 EYA3Q99504 573 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 TNNQ9UQP3 1299 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 XDHP47989 1333 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 LMNB1P20700 586 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 PTPREP23469 700 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ATP2B4P23634 1241 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 KCNJ4P48050 445 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 FOSBP53539 338 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 MTX1Q13505 466 aa6.75□□□□□ -1.33
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CS-210ENST00000547912 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 PSMD1Q99460 953 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 GGA1Q9UJY5 639 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CHD4Q14839 1912 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 TAF1P21675 1872 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 C6orf229H3BNL8 230 aa6.74□□□□□ -1.33
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