RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 LPIN2Q92539 896 aa22.09■■□□□ 1.13
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BRF1-209ENST00000547052 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 PODNQ7Z5L7 613 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 SLC51AQ86UW1 340 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-209ENST00000547052 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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BRF1-209ENST00000547052 RAB11FIP3O75154 756 aa22.07■■□□□ 1.12
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BRF1-209ENST00000547052 GORABQ5T7V8 394 aa22.07■■□□□ 1.12
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BRF1-209ENST00000547052 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.06■■□□□ 1.12
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BRF1-209ENST00000547052 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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BRF1-209ENST00000547052 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.04■■□□□ 1.12
BRF1-209ENST00000547052 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.04■■□□□ 1.12
BRF1-209ENST00000547052 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.04■■□□□ 1.12
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BRF1-209ENST00000547052 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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BRF1-209ENST00000547052 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
BRF1-209ENST00000547052 GPR108Q9NPR9 543 aa22.03■■□□□ 1.12
BRF1-209ENST00000547052 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
BRF1-209ENST00000547052 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
BRF1-209ENST00000547052 ZNF609O15014 1411 aa22.02■■□□□ 1.12
BRF1-209ENST00000547052 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.02■■□□□ 1.12
BRF1-209ENST00000547052 COL4A5P29400 1685 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 A0A1B0GUL7 405 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 USP17L3A6NCW0 530 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 USP17L4A6NCW7 530 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 APBB1O00213 710 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 RAD17O75943 681 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 CD209Q9NNX6 404 aa22.01■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.01■■□□□ 1.11
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BRF1-209ENST00000547052 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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BRF1-209ENST00000547052 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.98■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.98■■□□□ 1.11
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BRF1-209ENST00000547052 GCC1Q96CN9 775 aa21.98■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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BRF1-209ENST00000547052 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.98■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 YDJCA8MPS7 323 aa21.97■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 PSMD14O00487 310 aa21.97■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 SEMA3EO15041 775 aa21.97■■□□□ 1.11
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BRF1-209ENST00000547052 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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BRF1-209ENST00000547052 GPATCH3Q96I76 525 aa21.96■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 DCTPP1Q9H773 170 aa21.96■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 HACL1Q9UJ83 578 aa21.96■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.96■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.96■■□□□ 1.11
BRF1-209ENST00000547052 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 BCAMP50895 628 aa21.95■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 OGFOD1Q8N543 542 aa21.95■■□□□ 1.1
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