RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ALG1Q9BT22 464 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 GOPCQ9HD26 462 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 FSD2A1L4K1 749 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 HOXB7P09629 217 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC102AQ96A19 550 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PICK1Q9NRD5 415 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 LMAN1P49257 510 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 NAPAP54920 295 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ITSN1Q15811 1721 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PSMA7O14818 248 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PHACTR2O75167 634 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PDE6BP35913 854 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 FERP16591 822 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 RAD50Q92878 1312 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 UQCRHP07919 91 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 FAM193AP78312 1265 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TTC6Q86TZ1 520 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM47Q96LD4 638 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TUBB4AP04350 444 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SSFA2P28290 1259 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 STK32BQ9NY57 414 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 GCP02774 474 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 BRAPQ7Z569 592 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PLS1Q14651 629 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 LAMC1P11047 1609 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 IDEP14735 1019 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ALDH1B1P30837 517 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 FERMT3Q86UX7 667 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CEP152O94986 1710 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SNX16P57768 344 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC14Q49A88 953 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 FAM13AO94988 1023 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 GAS8O95995 478 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 RTL1A6NKG5 1358 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 HAND2P61296 217 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CNBD1Q8NA66 436 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.26□□□□□ -1.25
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