RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543125.5

PGA3-207, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-207ENST00000543125 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.32□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 SCN4AP35499 1836 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 SCN9AQ15858 1988 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 YDJCA8MPS7 323 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 SRGAP3O43295 1099 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 CXCL9Q07325 125 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 TNIP1Q15025 636 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 METTL24Q5JXM2 366 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 COG6Q9Y2V7 657 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.31□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 POTECB2RU33 542 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 SNAP23O00161 211 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 EYA2O00167 538 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 KLRK1P26718 216 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 MTX1Q13505 466 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 PDE3AQ14432 1141 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 MVPQ14764 893 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 SIL1Q9H173 461 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 PSME4Q14997 1843 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 PSMD14O00487 310 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 FSTL1Q12841 308 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 UBE4AQ14139 1066 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 C20orf194Q5TEA3 1177 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 COA1Q9GZY4 146 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 HACL1Q9UJ83 578 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 FBXO3Q9UK99 471 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 DDX19BQ9UMR2 479 aa11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 CIAO1O76071 339 aa11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 ATG9AQ7Z3C6 839 aa11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 PODNQ7Z5L7 613 aa11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 COPRSQ9NQ92 184 aa11.28□□□□□ -0.6
PGA3-207ENST00000543125 PDE8BO95263 885 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 EPHX2P34913 555 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 IL15P40933 162 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 SCNN1DP51172 638 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 RRP1P56182 461 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 ATP8B2P98198 1209 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 FBXW7Q969H0 707 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.27□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 USP17L3A6NCW0 530 aa11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 USP17L4A6NCW7 530 aa11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 EPS15P42566 896 aa11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 CD209Q9NNX6 404 aa11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 SLC5A1P13866 664 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 GYG1P46976 350 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 POLA2Q14181 598 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 ATP2B3Q16720 1220 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 CEP85Q6P2H3 762 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 VPS37DQ86XT2 251 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 SSH3Q8TE77 659 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 H7C1D1 291 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 IL1R1P14778 569 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 FGFR2P21802 821 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 GTF2IP78347 998 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 MICALL2Q8IY33 904 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 LPIN2Q92539 896 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-207ENST00000543125 DPF2Q92785 391 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms