RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF521Q96K83 1311 aa24.64■■□□□ 1.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 VAMP4O75379 141 aa24.64■■□□□ 1.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC4A2P04920 1241 aa24.64■■□□□ 1.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 NF2P35240 595 aa24.64■■□□□ 1.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.64■■□□□ 1.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 UFL1O94874 794 aa24.63■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 GGA1Q9UJY5 639 aa24.63■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 CACNA1FO60840 1977 aa24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 MOB2Q70IA6 237 aa24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 GMLQ99445 158 aa24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.62■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALDH1A1P00352 501 aa24.61■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCN9AQ15858 1988 aa24.6■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.6■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 KSR2Q6VAB6 950 aa24.6■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.6■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 PODNQ7Z5L7 613 aa24.59■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L3A6NCW0 530 aa24.58■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L4A6NCW7 530 aa24.58■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.58■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 MIER1Q8N108 512 aa24.58■■□□□ 1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 INHBEP58166 350 aa24.57■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 FLIIQ13045 1269 aa24.57■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.57■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 OGFOD1Q8N543 542 aa24.57■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.56■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.56■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGKV5-2P06315 115 aa24.55■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MMP14P50281 582 aa24.55■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.54■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM17Q9Y577 477 aa24.54■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 XDHP47989 1333 aa24.54■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.53■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.53■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.53■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL4A1P02462 1669 aa24.53■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP2B4P23634 1241 aa24.52■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPRYD7Q5W111 196 aa24.52■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.52■■□□□ 1.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 POTEFA5A3E0 1075 aa24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 WNT10BO00744 389 aa24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.51■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSME4Q14997 1843 aa24.5■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 E9PSI1 815 aa24.5■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLFN5Q08AF3 891 aa24.5■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.5■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.49■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.49■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.49■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 F6X3S4 739 aa24.48■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFNL1Q8IU54 200 aa24.48■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERO1AQ96HE7 468 aa24.48■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDE8AO60658 829 aa24.47■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYH3P11055 1940 aa24.46■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 DACT2Q5SW24 774 aa24.46■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.46■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.46■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.46■■□□□ 1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKG1Q13976 671 aa24.45■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARMC5Q96C12 935 aa24.45■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 HTTP42858 3142 aa24.44■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 MED23Q9ULK4 1368 aa24.44■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 UNCXA6NJT0 531 aa24.44■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.44■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.44■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 GCKRQ14397 625 aa24.43■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.43■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 COA1Q9GZY4 146 aa24.43■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 H7C1W4 665 aa24.42■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINS1Q8NG48 757 aa24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms